制藥工程潔凈室（區(qū)）以微粒和微生物為主要控制對(duì)象，同時(shí)還應(yīng)控制醫(yī)藥潔凈室（區(qū)）環(huán)境的溫度、濕度、壓差、照度、噪聲等參數(shù)，滿足藥品生產(chǎn)的各各環(huán)節(jié)的工藝要求，從而達(dá)到環(huán)境空氣中無異味以及無有礙藥品質(zhì)量和人體健康的氣體。

在2010版GMP中規(guī)定制藥工程的潔凈等級(jí)共有A級(jí)、B級(jí)、C級(jí)、D級(jí)四個(gè)等級(jí)，每一個(gè)等級(jí)都有不同的工藝參數(shù)要求。根據(jù)生產(chǎn)工藝要求的潔凈區(qū)分為4個(gè)級(jí)別：A級(jí)高風(fēng)險(xiǎn)操作區(qū)，通常用層流操作臺(tái)（罩）來維持該區(qū)的空氣環(huán)境狀態(tài)。層流系統(tǒng)在其工作區(qū)域必須均勻送風(fēng)，風(fēng)速為0.36～0.54m/s（指導(dǎo)值），應(yīng)有數(shù)據(jù)證明層流的狀態(tài)并須驗(yàn)證。在密閉的隔離操作器或手套箱內(nèi)，可使用單向流或較低的風(fēng)速；B級(jí)指無菌配制和灌裝等高風(fēng)險(xiǎn)操作A級(jí)區(qū)所處的背景區(qū)域；C級(jí)和D級(jí)指生產(chǎn)無菌藥品過程中重要程度較低的潔凈操作區(qū)。A、B、C級(jí)對(duì)靜態(tài)與動(dòng)態(tài)都有要求，D級(jí)只對(duì)靜態(tài)有要求。以夏季來說，在生產(chǎn)工藝對(duì)溫度和濕度無特殊要求時(shí)，空氣潔凈度A(B)級(jí)、C級(jí)的醫(yī)藥潔凈室（區(qū)）溫度應(yīng)為20～24℃，相對(duì)濕度應(yīng)為45%～60 % ；空氣潔凈度D級(jí)的溫度為18～26℃，相對(duì)濕度應(yīng)為45%～65%。制藥工程有無菌藥品生產(chǎn)、非無菌藥品生產(chǎn)、原料藥品生產(chǎn)、中藥制劑等等。